El Doctorado en Ciencias de la Educación de la Universidad del Magdalena es un programa académico debidamente aprobado por parte del Ministerio de Educación Nacional a través del Registro Calificado concedido el 28 de febrero de 2011 Resolución No.1566 – MEN, recientemente renovado mediante Resolución No. 06107 de abril 9 de 2018 – MEN. Desde sus dos líneas de formación: Pedagogía e Interculturalidad, y Administración y Desarrollo de los Sistemas Educativos, tiene como propósito sustancial, la formación de investigadores autónomos con las competencias para el estudio científico de los problemas educativos desde una perspectiva interdisciplinar y transdisciplinar, para plantear soluciones a la compleja red de problemas educativos del territorio y contextos de orden local, regional, nacional e internacional.